Nuclear |
Examined sequences (bp) | 119146348 |
tRNAs decoding Standard 20 AA | 632 |
Selenocysteine tRNAs (TCA) | 0 |
Possible suppressor tRNAs (CTA,TTA,TCA) | 0 |
tRNAs with undetermined/unknown isotypes | 2 |
Predicted pseudogenes | 8 |
Total tRNAs | 642 |
tRNAs with introns | 82 |
Isotype/Anticodon Counts | |
Ala:33 | AGC:16 GGC:0 CGC:7 TGC:10 |
Gly:41 | ACC:0 GCC:23 CCC:5 TCC:13 |
Pro:67 | AGG:17 GGG:0 CGG:5 TGG:45 |
Thr:23 | AGT:10 GGT:0 CGT:5 TGT:8 |
Val:30 | AAC:15 GAC:0 CAC:8 TAC:7 |
Ser:64 | AGA:37 GGA:1 CGA:4 TGA:9 ACT:0GCT:13 |
Arg:38 | ACG:9 GCG:0 CCG:5 TCG:6 CCT:8TCT:10 |
Leu:42 | AAG:12 GAG:1 CAG:3 TAG:10 CAA:10TAA:6 |
Phe:16 | AAA:0 GAA:16 |
Asn:16 | ATT:0 GTT:16 |
Lys:33 | CTT:18 TTT:15 |
Asp:27 | ATC:0 GTC:27 |
Glu:28 | CTC:14 TTC:14 |
His:10 | ATG:0 GTG:10 |
Gln:17 | CTG:9 TTG:8 |
Ile:22 | AAT:17 GAT:0 CAT:25 TAT:5 |
Met/iMet:25 | CAT:25 |
Tyr:76 | ATA:0 GTA:76 |
Supres:0 | CTA:0 TTA:0 TCA:0 |
Cys:16 | ACA:0 GCA:16 |
Trp:14 | CCA:14 |
SelCys:0 | TCA:0 |
Mitochondrial |
tRNAs decoding Standard 20 AA | 35 |
Selenocysteine tRNAs (TCA) | 0 |
Possible suppressor tRNAs (CTA,TTA,TCA) | 0 |
tRNAs with undetermined/unknown isotypes | 1 |
Predicted pseudogenes | 0 |
Total tRNAs | 36 |
tRNAs with introns | 2 |
Isotype/Anticodon Counts | |
Ala:0 | AGC:0 GGC:0 CGC:0 TGC:0 |
Gly:0 | ACC:0 GCC:0 CCC:0 TCC:0 |
Pro:1 | AGG:0 GGG:0 CGG:0 TGG:1 |
Thr:2 | AGT:0 GGT:1 CGT:0 TGT:1 |
Val:0 | AAC:0 GAC:0 CAC:0 TAC:0 |
Ser:7 | AGA:0 GGA:1 CGA:0 TGA:4 ACT:0GCT:2 |
Arg:0 | ACG:0 GCG:0 CCG:0 TCG:0 CCT:0TCT:0 |
Leu:0 | AAG:0 GAG:0 CAG:0 TAG:0 CAA:0TAA:0 |
Phe:2 | AAA:0 GAA:2 |
Asn:1 | ATT:0 GTT:1 |
Lys:2 | CTT:0 TTT:2 |
Asp:1 | ATC:0 GTC:1 |
Glu:1 | CTC:0 TTC:1 |
His:1 | ATG:0 GTG:1 |
Gln:1 | CTG:0 TTG:1 |
Ile:0 | AAT:0 GAT:0 CAT:0 TAT:0 |
Met/iMet:0 | CAT:0 |
Tyr:8 | ATA:0 GTA:8 |
Supres:0 | CTA:0 TTA:0 TCA:0 |
Cys:1 | ACA:0 GCA:1 |
Trp:1 | CCA:1 |
SelCys:0 | TCA:0 |
Chloroplast |
tRNAs decoding Standard 20 AA | 33 |
Selenocysteine tRNAs (TCA) | 0 |
Possible suppressor tRNAs (CTA,TTA,TCA) | 0 |
tRNAs with undetermined/unknown isotypes | 0 |
Predicted pseudogenes | 0 |
Total tRNAs | 33 |
tRNAs with introns | 4 |
Isotype/Anticodon Counts | |
Ala:2 | AGC:0 GGC:0 CGC:0 TGC:2 |
Gly:0 | ACC:0 GCC:0 CCC:0 TCC:0 |
Pro:1 | AGG:0 GGG:0 CGG:0 TGG:1 |
Thr:2 | AGT:0 GGT:1 CGT:0 TGT:1 |
Val:0 | AAC:0 GAC:0 CAC:0 TAC:0 |
Ser:3 | AGA:0 GGA:1 CGA:0 TGA:1 ACT:0GCT:1 |
Arg:3 | ACG:2 GCG:0 CCG:0 TCG:0 CCT:0TCT:1 |
Leu:0 | AAG:0 GAG:0 CAG:0 TAG:0 CAA:0TAA:0 |
Phe:1 | AAA:0 GAA:1 |
Asn:2 | ATT:0 GTT:2 |
Lys:0 | CTT:0 TTT:0 |
Asp:1 | ATC:0 GTC:1 |
Glu:1 | CTC:0 TTC:1 |
His:1 | ATG:0 GTG:1 |
Gln:1 | CTG:0 TTG:1 |
Ile:0 | AAT:0 GAT:0 CAT:0 TAT:0 |
Met/iMet:0 | CAT:0 |
Tyr:1 | ATA:0 GTA:1 |
Supres:0 | CTA:0 TTA:0 TCA:0 |
Cys:1 | ACA:0 GCA:1 |
Trp:1 | CCA:1 |
SelCys:0 | TCA:0 |